É claro que todos esses protocolos não eliminam um dos principais trabalhos do Analista do Comportamento, seja ele Terapeuta Ocupacional, Fonoaudiólogo, Psicólogo, Psicopedagogo, Pedagogo ou de qualquer outra formação, que é realizar análises funcionais, ou seja, descobrir porque o indivíduo se comporta de certa forma. Através do estudo científico do comportamento humano, por meio de processos muito bem estudados e validados pela pesquisa, podemos avaliar porque ocorre um comportamento como agressividade, autoagressividade, agitação, gritos, enfim, todas as possibilidades de comportamentos desadaptativos.
Além disso, é também pertinente ao trabalho do Analista do Comportamento para o planejamento de uma intervenção baseada em ABA a observação da pessoa que está sendo avaliada em outros contextos que lhe forem relevantes. No caso de crianças e adolescentes, é usual que se observe seu comportamento também na escola, para que o planejamento também planejar intervenções que permitam sua melhor adaptação ao ambiente escolar e também, é claro, sua melhor aprendizagemneste ambiente.